• Wyszukaj w całym Repozytorium
  • Piśmiennictwo i mapy
  • Archeologia
  • Baza Młynów
  • Nauki przyrodnicze

Szukaj w Repozytorium

Jak wyszukiwać...

Wyszukiwanie zaawansowane

Szukaj w Piśmiennictwo i mapy

Jak wyszukiwać...

Wyszukiwanie zaawansowane

Szukaj w Archeologia

Jak wyszukiwać...

Wyszukiwanie zaawansowane

Szukaj w Baza Młynów

Jak wyszukiwać...

Wyszukiwanie zaawansowane

Szukaj w Nauki przyrodnicze

Jak wyszukiwać...

Wyszukiwanie zaawansowane

Projekty RCIN i OZwRCIN

Obiekt

Tytuł: Biological databases and their application for functional comparative analysis of organisms - selected issues

Twórca:

Ślesak, Ireneusz ; Karpiński, Stanisław

Data wydania/powstania:

2010

Typ zasobu:

Text

Inny tytuł:

Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology

Wydawca:

Committee on Biotechnology PAS ; Institute of Bioorganic Chemistry PAS

Opis:

praca przeglądowa

Abstrakt:

A quickly increasing amount of biological data, such as DNA/RNA and protein sequences, determines fundamental role of biological databases for functional comparative analysis of genomes/metabolic pathways of various organisms. This is neatly illustrated by ‘Databases’, the new type of scientific Journal that has recently appeared. The Journal is dedicated to bioinformatic data processing and storage. Biological databases and platforms play a crucial role in the development and progress of the systems biology. Systems biology integrates key elements of an organism functions e.g. gene and protein content, regulation of gene expression, enzymes activities, and specific profiles of different metabolites. Therefore, it is possible to generate a holistic and integrated model of basic biological functions and processes that determine an organism phenotype.

Bibliografia:

Lesk A. M., (2003), Introduction to Bioinformatics, Oxford University Press, 115-159.
Selzer P. M., Marhofer R. J., Rohwer A., (2008), Applied Bioinformatics. An Introduction, Springer-Ver- lag Berlin Heidelberg, 1-30.
Xiong J., (2006), Essential bioinformatics, Cambridge University Press, 63-74.
Mackiewicz P., Zakrzewska-Czerwińska J., Cebrat S., (2005), Biotechnologia, 3, 7-21.
Venter J. C., Adams M. D., Myers E. W., et al., (2001), Science, 291, 1304-1351.
McPherson J. D., Marra M., Hillier L., et al., (2001), Nature, 409, 934-941.
Robbins R. J., (1994), Publishing Research Quarterly, 10, 3-27.
Baxevanis A. D., (2003), Current Protocols in Bioinformatics, john Wiley & Sons, Inc., 1.1.1-1.1.4.
Stein L. D., (2003), Nature Rev. Genet., 4, 337-345.
Selzer P. M., Marhofer R. J., Rohwer A., (2008), Applied Bioinformatics. Art Introduction, Springer-Ver- lag Berlin Heidelberg, 45-74.
Baxevanis A. D., Ouellette B. F. F., (2004), Bioinformatyka, Podręcznik do analizy genów i białek, PWN, Wraszawa, 490.
Higgs P. G., Attwood T. K., (2008), Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, Warszawa, 531.
Menlove K.J., Clement M., Crandall K. A., (2009), Bioinformatics for DNA Sequence Analysis. Series: Methods in Molecular Biology, 537, Ed. D. Posada, Humana Press, 1-22.
Galperin M. Y., Cochrane G. R., (2009), Nucleic Acid Res., 37, D1-D4.
Huang S., Ruiqiang Li R., Zhang Z., et al., (2009), Nat. Genet., 41, 1275-1281.
Schnoes A. M., Brown S. D., Dodevski I., Babbitt P.C., (2009), Plos Comput. Biol., 5, 1-13.
Altschul S. F., Gish W., Miller W., Myers E. W., Lipman D.J., (1990), J. Mol. Biol., 215, 403-410.
Altschul S. F., Madden T. L., Schaffer A. A., ZhangJ., Zhang Z., Miller W., Lipman D. J., (1997), Nucleic Acids Res., 25, 3389-3402.
Claverie J-M., Notredame C., (2007), Bioinformatics for dummies, 2"^ ed., Wiley Publishing Inc., 199-234.
Holmes R. M., (2007), A cell biologist’s guide to modeling and bioinformatics, John Wiley & Sons, Inc., 9-34.
Dereeper A., Guignon V., Blanc G., Audic S., Buffet S., Chevenet F., Dufayard J. F., Guindon S., Lefort V., Lescot M., Claverie J. M., Gascuel 0., (2008), Nucleic Acids Res., 36, W465-469.
Edgar R. C., (2004), Nucleic Acids Res., 32, 1792-1797.
Castresana J., (2000), Mol. Biol. EvoL, 17, 540-552.
Hall B. G., (2005), Mol. Biol. EvoL, 22, 792-802.
Hasegawa M., Kishino H., Yano T., (1985), J. Mol. EvoL, 2, 160-174.
Whelan A., Goldman N., (2001), Mol. Biol. EvoL, 18, 691-699.
Anisimova M., Gascuel 0., (2006), Syst. Biol., 55, 539-552.
Karp P. D., Ouzounis C. A., Moore-Kochlac C., Goldovsky L., Kaipa P., Ahren D., Tsoka S., Darzentas N., Kunin V., Lopez-Bigas N., (2005), Nucleic Acids Res., 33, 6083-6089.
Keseler I. M., Bonavides-Martinez C., Collado-Vides J., Gama-Castro S., Gunsalus R. P., Johnson D. A., Krummenacker M., Nolan L. M., Paley S., Paulsen I. T., et al., (2009), Nucleic Acids Res., 37, D464-D470.
Caspi R., Foerster, H., Fulcher C. A., Kaipa P., Krummenacker M., Latendresse M., Paley S., Rhee S.Y., Shearer A., Tissier C., Walk T. C., Zhang P., Karp P. D., (2008), Nucleic Acids Res., 36(1), D623-D631.
Romero P., Waggj., Green M. L., Kaiser D., Krummenacker M., Karp P. D., (2004), Genome Biol., 6, R2.
Valdes J., Veloso F., Jedlicki E., Holmes D., (2003), BMC Genomics, 15, 51.
Yell L, Hanekamp T., Tsoka S., Karp P. D., Altman R. B., (2004), Genome Res., 14, 917-924.
Geisler M., Kleczkowski L. A., Karpiński S., (2006), Plant j., 45, 384-398.
Landsman D. , Gentlemanm R., Kelso j., Ouellette B. F. F., (2009), Database, ID bap002, doi;10.1093/da- tabase/bap002.
de Backer P., Waele D. D., van Speybroeck L., (2010), Acta Biotheor., 58, 15-49.

Czasopismo/Seria/cykl:

Biotechnologia, vol.91, 4 (2010)-.

Tom:

91

Zeszyt:

4

Strona pocz.:

39

Strona końc.:

52

Szczegółowy typ zasobu:

Article

Format:

application/pdf

Identyfikator zasobu:

oai:rcin.org.pl:69104 ; 0860-7796

Źródło:

Library of Institute of Bioorganic Chemistry PAS

Język:

pol

Język streszczenia:

eng

Zakres czasowy:

2010

Prawa:

Creative Commons Attribution BY-SA 4.0 license

Zasady wykorzystania:

Copyright-protected material. [CC BY-SA 4.0] May be used within the scope specified in Creative Commons Attribution BY-SA 4.0 license, full text available at:

Digitalizacja:

Institute of Bioorganic Chemistry of the Polish Academy of Science

Lokalizacja oryginału:

Institute of Bioorganic Chemistry of the Polish Academy of Science

Dofinansowane ze środków:

Operational Program Digital Poland, 2014-2020, Measure 2.3: Digital accessibility and usefulness of public sector information; funds from the European Regional Development Fund and national co-financing from the state budget.

Dostęp:

Open

Kolekcje, do których przypisany jest obiekt:

Data ostatniej modyfikacji:

2 paź 2020

Data dodania obiektu:

6 mar 2019

Liczba pobrań / odtworzeń:

8672

Wszystkie dostępne wersje tego obiektu:

https://rcin.org.pl./publication/90346

Wyświetl opis w formacie RDF:

RDF

Wyświetl opis w formacie RDFa:

RDFa

Wyświetl opis w formacie OAI-PMH:

OAI-PMH

Obiekty Podobne

×

Cytowanie

Styl cytowania:

Ta strona wykorzystuje pliki 'cookies'. Więcej informacji