Institutional creator:

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. M. Mossakowskiego PAN

Contributor:

Misicka-Kęsik, Aleksandra (Promotor) ; Lipiński, Piotr F.J. (Promotor)

Publisher:

Instytut Medycyny Doswiadczalnej i Klinicznej im. Miroslawa Mossakowskiego PAN

Place of publishing:

Warszawa

Degree name:

doktor

Level of degree:

2

Degree discipline :

nauki medyczne

Degree grantor:

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. M. Mossakowskiego PAN

Type of object:

Praca dyplomowa

Coordinate uncertainty in meters:

Dokowanie

Abstract:

Receptor tachykininowy NK1 (NK1R) wraz ze swoim endogennym ligandem, substancją P, uczestniczy w regulacji wielu procesów fizjologicznych i patologicznych, co czyni go ważnym terapeutycznym celem molekularnym. Nowsze podejścia do wykorzystania NK1R jako punktu uchwytu dla terapii wymagają poszukiwania nowych ligandów tego receptora lub stosownych modyfikacji związków już istniejących. Pierwszym celem niniejszej pracy było zaprojektowanie i synteza biblioteki nowych pochodnych fenyloalaniny i tryptofanu jako potencjalnych ligandów NK1R. Otrzymano 94 związki, które poddano ewaluacji biologicznej. Badania powinowactwa receptorowego wobec NK1R posłużyły analizie zależności struktura–aktywność w otrzymanych bibliotekach w kontekście receptora NK1. Cześć z otrzymanych związków testowana była również w badaniu wpływu na żywotność komórek. Przebadane związki cechowały się zróżnicowaną aktywnością wobec komórek nowotworowych COLO679 i prawidłowych BJ. Drugim celem pracy było opracowanie funkcji oceniających specyficznych dla receptora NK1. W pierwszym etapie wykazano, że oryginalna funkcja oceniająca programu AutoDock Vina stosunkowo słabo radzi sobie w szacowaniu energii wiązania ligandów z NK1R i odróżnianiu związków aktywnych od nieaktywnych. Kolejno, uzyskane dane eksperymentalne o powinowactwie receptorowym nowosyntezowanych związków oraz dane literaturowe wykorzystano do wytrenowania funkcji specyficznych dla NK1R. Otrzymano nowe funkcje oceniające, które w przesiewie wirtualnym były skuteczniejsze niż oryginalna funkcja oceniająca programu AutoDock Vina.

Detailed Resource Type:

Praca doktorska

Resource Identifier:

oai:rcin.org.pl:242406

Source:

IMDiK PAN, ZS 437 ; click here to follow the link

Language:

pol

Rights:

Licencja Creative Commons Uznanie autorstwa 4.0

Terms of use:

- ; Zasób chroniony prawem autorskim. [CC BY 4.0 Międzynarodowe] Korzystanie dozwolone zgodnie z licencją Creative Commons Uznanie autorstwa 4.0, której pełne postanowienia dostępne są pod adresem:

Digitizing institution:

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. M. Mossakowskiego Polskiej Akademii Nauk

Original in:

Biblioteka Instytutu Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. M. Mossakowskiego PAN

Access:

Otwarty